<div dir="ltr">Hi Naomi and Houjun,<div><br></div><div>I&#39;ll chime in quickly on the parallel script workflow.</div><div><br></div><div>That para_config file is used to submit a job that:</div><div><br></div><div>runs /scratch3/NCEPDEV/swpc/svn/gfs/branches/gfs_workflow.v2.0.0/para/jobs/fcst.sh<br></div><div>fcst.sh immediately calls the para_config before running anything else<br></div><div>para_config then calls /scratch3/NCEPDEV/swpc/svn/gfs/branches/gfs_workflow.v2.0.0/para/ush/reconcile.sh<br></div><div>after reconcile.sh, para_config finishes as well, and then fcst.sh runs<br></div><div>fcst.sh calls /scratch3/NCEPDEV/swpc/svn/gfs/branches/global_shared.v14.0.0/scripts/exglobal_fcst_nems.sh.ecf-wam-ipe_wdas_iau2<br><br></div><div>A lot of what&#39;s relevant to IPE itself (copying in or linking files to the RUNDIR, setting up the namelists, etc.) is going to occur in that final exglobal script.<br><br></div><div>Let me know if there&#39;s anything else I can clarify.<br><br></div><div>Best,<br></div><div>Adam<br></div></div><div class="gmail_extra"><br><div class="gmail_quote">On Wed, Jul 12, 2017 at 4:22 PM, Houjun Wang - NOAA Affiliate <span dir="ltr">&lt;<a href="mailto:houjun.wang@noaa.gov" target="_blank">houjun.wang@noaa.gov</a>&gt;</span> wrote:<br><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex"><div dir="ltr">1. Yes, we have hourly output from ipe and since this WDAS-IAU cycled runs, each run only have 12 hour duration (and since ipe doesn&#39;t output the last time step - George know this well and may have a fix for it now - it does&#39;t have 15 UT for example).<div><br></div><div>So this is not an issue.</div><div>







<p class="m_-2897043307068363127gmail-m_3460520077816139387gmail-p1"><span class="m_-2897043307068363127gmail-m_3460520077816139387gmail-s1">2. The source code is inĀ </span></p><p class="m_-2897043307068363127gmail-m_3460520077816139387gmail-p1">/scratch3/NCEPDEV/swpc/svn/nem<wbr>s/WAM-IPE_NEMS201606_IAU<br></p><p class="m_-2897043307068363127gmail-m_3460520077816139387gmail-p1"><span class="m_-2897043307068363127gmail-m_3460520077816139387gmail-s1">see especially the mods in</span></p><p class="m_-2897043307068363127gmail-m_3460520077816139387gmail-p1"><span class="m_-2897043307068363127gmail-m_3460520077816139387gmail-s1">/scratch3/NCEPDEV/swpc/svn/nem<wbr>s/WAM-IPE_NEMS201606_IAU/IPELI<wbr>B/src/plasma/</span><span style="font-variant-ligatures:no-common-ligatures;color:rgb(0,0,0);font-family:Menlo;font-size:11px">io_plasma_bin.f90</span></p>







<p class="m_-2897043307068363127gmail-m_3460520077816139387gmail-p1"><span class="m_-2897043307068363127gmail-m_3460520077816139387gmail-s1">for initializing ipe from ipe output from previous cycle in WDAS-IAU.<br></span></p><p class="m_-2897043307068363127gmail-m_3460520077816139387gmail-p1">I added another option &quot;sw_record_number=2&quot; for this, see IPE.inp for more details and other changes. I also reset record number to zero for each run in WDAS-IAU cycles to make it more practical for this purpose.</p><p class="m_-2897043307068363127gmail-m_3460520077816139387gmail-p1"><span class="m_-2897043307068363127gmail-m_3460520077816139387gmail-s1">3. Now, since I am using EMC para workflow, there is not just one script.</span></p><p class="m_-2897043307068363127gmail-m_3460520077816139387gmail-p1"><span class="m_-2897043307068363127gmail-m_3460520077816139387gmail-s1">The config file I am using is:</span></p><p class="m_-2897043307068363127gmail-m_3460520077816139387gmail-p1"><span class="m_-2897043307068363127gmail-m_3460520077816139387gmail-s1">







</span></p><p class="m_-2897043307068363127gmail-m_3460520077816139387gmail-p1"><span class="m_-2897043307068363127gmail-m_3460520077816139387gmail-s1">/scratch3/NCEPDEV/swpc/save/sw<wbr>pc.spacepara/para/</span><span style="font-variant-ligatures:no-common-ligatures;color:rgb(0,0,0);font-family:Menlo;font-size:11px">para_config_<wbr>wam_ipe_wdas_iau</span></p>







<p class="m_-2897043307068363127gmail-m_3460520077816139387gmail-p1"><span class="m_-2897043307068363127gmail-m_3460520077816139387gmail-s1">which defines all the runs.</span></p><p class="m_-2897043307068363127gmail-m_3460520077816139387gmail-p1"><span class="m_-2897043307068363127gmail-m_3460520077816139387gmail-s1">Kate wrote some notes on using EMC para scripts/workflow for wam/wdas:</span></p><p class="m_-2897043307068363127gmail-m_3460520077816139387gmail-p1"><span class="m_-2897043307068363127gmail-m_3460520077816139387gmail-s1"><a href="https://docs.google.com/a/noaa.gov/document/d/1OmlGZc0WQy8kdjdPWqHLQZUVn47fXqTn41rbgyrCguc/edit?usp=sharing" style="font-size:12.8px" target="_blank">https://docs.google.com/a/noaa<wbr>.gov/document/d/1OmlGZc0WQy8kd<wbr>jdPWqHLQZUVn47fXqTn41rbgyrCguc<wbr>/edit?usp=sharing</a><br></span></p><p class="m_-2897043307068363127gmail-m_3460520077816139387gmail-p1">l&#39;ll see if I can answer if you have questions.</p></div></div><div class="gmail_extra"><span class="HOEnZb"><font color="#888888"><br clear="all"><div><div class="m_-2897043307068363127gmail_signature" data-smartmail="gmail_signature"><div dir="ltr"><div><div dir="ltr">Houjun Wang</div></div></div></div></div></font></span><div><div class="h5">
<br><div class="gmail_quote">On Wed, Jul 12, 2017 at 1:24 PM, Naomi Maruyama - NOAA Affiliate <span dir="ltr">&lt;<a href="mailto:naomi.maruyama@noaa.gov" target="_blank">naomi.maruyama@noaa.gov</a>&gt;</span> wrote:<br><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex"><div dir="ltr">Houjun,<div><br></div><div>Thank you very much for your kindly sharing your output files.</div><div><br></div><div>I have a feeling that your IPE output files were generated from only 3UT to 14UT only for each day, after looking at some of your IPE ARCHIVE directory.</div><div><br></div><div>In order to understand this potential issue in further detail, I would need to understand how your restart of IPE has been set up in your script and source code. Would you mind sharing your script and source code with which you have generated these output files?</div><div><br></div><div>Thanks.</div><div>naomi</div><div><br></div><div><br><div><br></div></div></div><div class="gmail_extra"><div><div class="m_-2897043307068363127h5"><br><div class="gmail_quote">On Tue, Jul 11, 2017 at 3:49 PM, Houjun Wang - NOAA Affiliate <span dir="ltr">&lt;<a href="mailto:houjun.wang@noaa.gov" target="_blank">houjun.wang@noaa.gov</a>&gt;</span> wrote:<br><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex"><div dir="ltr"><div>Hello,</div><div><br></div><div>Some info on realtime wam-ipe runs on theia:</div><div><br></div><div>1) RUNDIR (this is temporary dir and it could be gone anytime)</div><div><br></div><div><div>/scratch4/NCEPDEV/stmp4/swpc.s<wbr>pacepara/wam2017070506gdasfcst<wbr>1</div></div><div><br></div><div>2) ARCHIVE (not all files are saved for ipe; what else should be saved?)</div><div><br></div><div><div>/scratch3/NCEPDEV/swpc/noscrub<wbr>/swpc.spacepara/archive/ipe</div></div><div><br></div><div>3) HPSS ARCHIVE (George can get ICs for WAM here):</div><div><br></div><div>/5year/NCEPDEV/swpc-para/swpc.<wbr>spacepara/THEIA/prwam_ipe<br></div><div><br></div><div>Let me know if you have any questions or suggestions.</div><div><br></div><div>Best,</div><div><br></div><div><div class="m_-2897043307068363127m_3873999350302384944m_-6687529716373526668gmail_signature"><div dir="ltr"><div><div dir="ltr">Houjun Wang</div></div></div></div></div>
</div>
</blockquote></div><br><br clear="all"><div><br></div></div></div><span class="m_-2897043307068363127HOEnZb"><font color="#888888">-- <br><div class="m_-2897043307068363127m_3873999350302384944gmail_signature" data-smartmail="gmail_signature"><div dir="ltr"><span><font color="#888888"><pre cols="72">Naomi Maruyama
CIRES, Univ. of Colorado Boulder
NOAA Space Weather Prediction Center
phone: <a href="tel:%28303%29%20497-4857" value="+13034974857" target="_blank">+1 303.497.4857</a>
email: <a href="mailto:naomi.maruyama@noaa.gov" target="_blank">naomi.maruyama@noaa.gov</a>
</pre>
  </font></span></div></div>
</font></span></div>
</blockquote></div><br></div></div></div>
<br>______________________________<wbr>_________________<br>
WAM-IPE mailing list<br>
<a href="mailto:WAM-IPE@lstsrv.ncep.noaa.gov">WAM-IPE@lstsrv.ncep.noaa.gov</a><br>
<a href="https://www.lstsrv.ncep.noaa.gov/mailman/listinfo/wam-ipe" rel="noreferrer" target="_blank">https://www.lstsrv.ncep.noaa.<wbr>gov/mailman/listinfo/wam-ipe</a><br>
<br></blockquote></div><br></div>